MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. pomaceae ATCC 29192 plasmid pZYMOP02

Total Repeats: 434

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015716	GAAA	2	8	158	165	75 %	0 %	25 %	0 %	338708712
2	NC_015716	GTA	2	6	272	277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708712
3	NC_015716	AGA	2	6	417	422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338708712
4	NC_015716	TTC	2	6	423	428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708712
5	NC_015716	A	6	6	491	496	100 %	0 %	0 %	0 %	338708712
6	NC_015716	TTG	2	6	573	578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338708712
7	NC_015716	TTA	2	6	614	619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338708712
8	NC_015716	TCA	2	6	633	638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708712
9	NC_015716	TAC	2	6	645	650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708712
10	NC_015716	ATT	2	6	754	759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338708712
11	NC_015716	CTTA	2	8	779	786	25 %	50 %	0 %	25 %	338708712
12	NC_015716	TTC	2	6	801	806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708712
13	NC_015716	ATTTT	2	10	881	890	20 %	80 %	0 %	0 %	338708712
14	NC_015716	A	7	7	936	942	100 %	0 %	0 %	0 %	338708712
15	NC_015716	AGTATT	2	12	951	962	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	338708712
16	NC_015716	ATG	2	6	1028	1033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708712
17	NC_015716	TAA	3	9	1057	1065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338708712
18	NC_015716	TCA	2	6	1209	1214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708713
19	NC_015716	TGC	2	6	1314	1319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708713
20	NC_015716	GAT	2	6	1321	1326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708713
21	NC_015716	A	6	6	1334	1339	100 %	0 %	0 %	0 %	338708713
22	NC_015716	GT	3	6	1346	1351	0 %	50 %	50 %	0 %	338708713
23	NC_015716	TAT	2	6	2284	2289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338708714
24	NC_015716	AC	4	8	3068	3075	50 %	0 %	0 %	50 %	338708715
25	NC_015716	CTT	2	6	3110	3115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708715
26	NC_015716	CTTG	2	8	3167	3174	0 %	50 %	25 %	25 %	338708715
27	NC_015716	GTCA	2	8	3228	3235	25 %	25 %	25 %	25 %	338708715
28	NC_015716	AAGC	2	8	3706	3713	50 %	0 %	25 %	25 %	338708716
29	NC_015716	CCAT	2	8	3727	3734	25 %	25 %	0 %	50 %	338708716
30	NC_015716	CTGGA	2	10	3744	3753	20 %	20 %	40 %	20 %	338708716
31	NC_015716	AACG	2	8	4435	4442	50 %	0 %	25 %	25 %	338708717
32	NC_015716	T	8	8	4467	4474	0 %	100 %	0 %	0 %	338708717
33	NC_015716	TCGC	2	8	4538	4545	0 %	25 %	25 %	50 %	338708717
34	NC_015716	TTC	2	6	4618	4623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708717
35	NC_015716	A	7	7	4657	4663	100 %	0 %	0 %	0 %	338708717
36	NC_015716	TGAT	2	8	4712	4719	25 %	50 %	25 %	0 %	338708717
37	NC_015716	CGA	2	6	4725	4730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338708717
38	NC_015716	CG	3	6	4744	4749	0 %	0 %	50 %	50 %	338708717
39	NC_015716	ACG	2	6	4774	4779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338708717
40	NC_015716	T	7	7	4812	4818	0 %	100 %	0 %	0 %	338708717
41	NC_015716	ATTT	2	8	4855	4862	25 %	75 %	0 %	0 %	338708717
42	NC_015716	GAC	2	6	4891	4896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338708717
43	NC_015716	ATC	2	6	4897	4902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708717
44	NC_015716	CAG	2	6	5004	5009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338708717
45	NC_015716	GTC	2	6	5029	5034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708717
46	NC_015716	TCA	3	9	5039	5047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708717
47	NC_015716	ATG	2	6	5053	5058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708717
48	NC_015716	TCG	2	6	5096	5101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708717
49	NC_015716	CT	3	6	5113	5118	0 %	50 %	0 %	50 %	338708717
50	NC_015716	TCA	2	6	5132	5137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708717
51	NC_015716	TCT	2	6	5193	5198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708717
52	NC_015716	GAC	2	6	5254	5259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338708717
53	NC_015716	CGC	2	6	5273	5278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338708717
54	NC_015716	ACG	2	6	5339	5344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338708717
55	NC_015716	CAT	2	6	5439	5444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708717
56	NC_015716	CGA	2	6	5502	5507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338708717
57	NC_015716	TAA	2	6	5609	5614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338708717
58	NC_015716	GGC	2	6	5677	5682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338708717
59	NC_015716	GCT	2	6	5701	5706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708717
60	NC_015716	TTC	2	6	5761	5766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708717
61	NC_015716	A	6	6	5781	5786	100 %	0 %	0 %	0 %	338708717
62	NC_015716	ATA	2	6	5842	5847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338708717
63	NC_015716	GCT	2	6	5866	5871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708717
64	NC_015716	TTCG	2	8	5967	5974	0 %	50 %	25 %	25 %	338708717
65	NC_015716	CGG	3	9	6000	6008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338708717
66	NC_015716	CTT	2	6	6013	6018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708717
67	NC_015716	TCG	2	6	6095	6100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708717
68	NC_015716	CGT	2	6	6154	6159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708717
69	NC_015716	TTC	2	6	6242	6247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708717
70	NC_015716	TCG	2	6	6278	6283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708717
71	NC_015716	GAC	2	6	6292	6297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338708717
72	NC_015716	TCA	2	6	6333	6338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708717
73	NC_015716	TTG	2	6	6341	6346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338708717
74	NC_015716	GAT	2	6	6367	6372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708717
75	NC_015716	TTG	2	6	6374	6379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338708717
76	NC_015716	GCC	2	6	6542	6547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338708717
77	NC_015716	AT	3	6	6590	6595	50 %	50 %	0 %	0 %	338708717
78	NC_015716	CCG	2	6	6596	6601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338708717
79	NC_015716	CGC	2	6	6667	6672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338708717
80	NC_015716	CAG	2	6	6694	6699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338708717
81	NC_015716	CAA	2	6	6742	6747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338708717
82	NC_015716	GAA	2	6	6760	6765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338708717
83	NC_015716	GTT	2	6	6838	6843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338708717
84	NC_015716	CT	3	6	6944	6949	0 %	50 %	0 %	50 %	338708717
85	NC_015716	CGC	2	6	6993	6998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338708717
86	NC_015716	TGA	2	6	7092	7097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708717
87	NC_015716	TTG	2	6	7106	7111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338708717
88	NC_015716	GACA	2	8	7113	7120	50 %	0 %	25 %	25 %	338708717
89	NC_015716	AGAT	2	8	7136	7143	50 %	25 %	25 %	0 %	338708717
90	NC_015716	CAT	2	6	7158	7163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708717
91	NC_015716	GTC	2	6	7186	7191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708717
92	NC_015716	GC	3	6	7255	7260	0 %	0 %	50 %	50 %	338708717
93	NC_015716	CAT	2	6	7284	7289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708717
94	NC_015716	GTTG	2	8	7330	7337	0 %	50 %	50 %	0 %	338708717
95	NC_015716	TCAGG	2	10	7341	7350	20 %	20 %	40 %	20 %	338708717
96	NC_015716	GGTC	2	8	7401	7408	0 %	25 %	50 %	25 %	338708717
97	NC_015716	GCC	2	6	7427	7432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338708717
98	NC_015716	GC	3	6	7439	7444	0 %	0 %	50 %	50 %	338708717
99	NC_015716	TCA	2	6	7503	7508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708717
100	NC_015716	ATC	2	6	7524	7529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708718
101	NC_015716	TTG	2	6	7557	7562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338708718
102	NC_015716	GTT	2	6	7618	7623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338708718
103	NC_015716	CAT	2	6	7795	7800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708718
104	NC_015716	TCAA	2	8	7824	7831	50 %	25 %	0 %	25 %	338708718
105	NC_015716	GAT	2	6	7837	7842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708718
106	NC_015716	CTT	2	6	7922	7927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708718
107	NC_015716	TGA	2	6	7972	7977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708718
108	NC_015716	AG	3	6	8058	8063	50 %	0 %	50 %	0 %	338708718
109	NC_015716	TCA	2	6	8073	8078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708718
110	NC_015716	TTG	2	6	8106	8111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338708718
111	NC_015716	CCTCAG	2	12	8122	8133	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	338708718
112	NC_015716	CTT	2	6	8155	8160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708718
113	NC_015716	CGT	2	6	8225	8230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708718
114	NC_015716	TCA	2	6	8235	8240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708718
115	NC_015716	TTG	2	6	8331	8336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338708718
116	NC_015716	CGT	2	6	8362	8367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708718
117	NC_015716	T	6	6	8500	8505	0 %	100 %	0 %	0 %	338708718
118	NC_015716	TCG	2	6	8535	8540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708718
119	NC_015716	CTT	2	6	8630	8635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708718
120	NC_015716	TAA	2	6	8733	8738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338708719
121	NC_015716	GTC	2	6	8793	8798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708719
122	NC_015716	CGA	2	6	8824	8829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338708719
123	NC_015716	TTC	2	6	8840	8845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708719
124	NC_015716	CG	3	6	8922	8927	0 %	0 %	50 %	50 %	338708719
125	NC_015716	GCTT	2	8	8994	9001	0 %	50 %	25 %	25 %	338708719
126	NC_015716	CAG	3	9	9018	9026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338708719
127	NC_015716	ATA	2	6	9093	9098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338708719
128	NC_015716	GGC	2	6	9122	9127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338708719
129	NC_015716	CAT	2	6	9223	9228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708719
130	NC_015716	CCG	2	6	9244	9249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338708719
131	NC_015716	TCA	2	6	9315	9320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708719
132	NC_015716	GTTG	2	8	9331	9338	0 %	50 %	50 %	0 %	338708719
133	NC_015716	ATC	2	6	9458	9463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708719
134	NC_015716	GCCC	2	8	9516	9523	0 %	0 %	25 %	75 %	338708719
135	NC_015716	GGA	2	6	9541	9546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338708719
136	NC_015716	CGT	2	6	9554	9559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708719
137	NC_015716	GTT	2	6	9620	9625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338708719
138	NC_015716	TGT	2	6	9742	9747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338708719
139	NC_015716	GTA	2	6	9755	9760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708719
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141	NC_015716	GC	3	6	9803	9808	0 %	0 %	50 %	50 %	338708719
142	NC_015716	A	6	6	9825	9830	100 %	0 %	0 %	0 %	338708719
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148	NC_015716	CG	3	6	10008	10013	0 %	0 %	50 %	50 %	338708720
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262	NC_015716	T	7	7	16564	16570	0 %	100 %	0 %	0 %	338708724
263	NC_015716	GTG	2	6	16593	16598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338708724
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265	NC_015716	AGAT	2	8	16693	16700	50 %	25 %	25 %	0 %	338708724
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269	NC_015716	ATT	2	6	16931	16936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338708724
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271	NC_015716	T	6	6	17087	17092	0 %	100 %	0 %	0 %	338708724
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280	NC_015716	CTT	2	6	17286	17291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708724
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393	NC_015716	TTA	2	6	30820	30825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338708740
394	NC_015716	GAT	2	6	30838	30843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708740
395	NC_015716	GCT	3	9	30852	30860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708740
396	NC_015716	TTTG	2	8	30888	30895	0 %	75 %	25 %	0 %	338708740
397	NC_015716	TGT	2	6	30921	30926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338708740
398	NC_015716	CTT	2	6	30970	30975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708740
399	NC_015716	TTCCT	2	10	31008	31017	0 %	60 %	0 %	40 %	338708740
400	NC_015716	TGT	2	6	31049	31054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338708740
401	NC_015716	GAT	2	6	31059	31064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708740
402	NC_015716	AGA	2	6	31635	31640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338708741
403	NC_015716	AGA	2	6	31726	31731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338708741
404	NC_015716	CTGA	2	8	32040	32047	25 %	25 %	25 %	25 %	338708742
405	NC_015716	GAA	3	9	32073	32081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338708742
406	NC_015716	AAG	2	6	32148	32153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338708742
407	NC_015716	CTTCTG	2	12	32381	32392	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	338708743
408	NC_015716	ACT	2	6	32395	32400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708743
409	NC_015716	TCT	2	6	32407	32412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708743
410	NC_015716	AAG	2	6	32570	32575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338708743
411	NC_015716	GGC	2	6	32814	32819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338708743
412	NC_015716	CAG	2	6	32851	32856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338708743
413	NC_015716	GC	3	6	32899	32904	0 %	0 %	50 %	50 %	338708743
414	NC_015716	CAG	2	6	32909	32914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338708743
415	NC_015716	CCGT	2	8	33122	33129	0 %	25 %	25 %	50 %	338708743
416	NC_015716	GGC	2	6	33170	33175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338708743
417	NC_015716	CGA	2	6	33224	33229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338708743
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419	NC_015716	AG	3	6	33382	33387	50 %	0 %	50 %	0 %	338708743
420	NC_015716	AAG	2	6	33412	33417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338708743
421	NC_015716	GAT	2	6	33430	33435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708743
422	NC_015716	GGA	2	6	33453	33458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338708743
423	NC_015716	GCT	2	6	33463	33468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708743
424	NC_015716	AGA	2	6	33624	33629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338708743
425	NC_015716	GAC	2	6	33708	33713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338708743
426	NC_015716	TTAT	2	8	33777	33784	25 %	75 %	0 %	0 %	338708743
427	NC_015716	AAC	2	6	33810	33815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338708743
428	NC_015716	GCG	2	6	33831	33836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338708743
429	NC_015716	A	6	6	33886	33891	100 %	0 %	0 %	0 %	338708743
430	NC_015716	AAT	2	6	33898	33903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338708743
431	NC_015716	CTA	2	6	33953	33958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708743
432	NC_015716	ACC	2	6	33965	33970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338708743
433	NC_015716	CT	3	6	34001	34006	0 %	50 %	0 %	50 %	338708743
434	NC_015716	CCT	2	6	34026	34031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338708743

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.